<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">ivm</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Международный вестник ветеринарии</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>International Journal of Veterinary Medicine</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2072-2419</issn><publisher><publisher-name>SpbGUVM Publishing House</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.52419/issn2072-2419.2023.3.275</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">ivm-1141</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>АКУШЕРСТВО, ГИНЕКОЛОГИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>OBSTETRICS, GYNECOLOGY</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Изменения микросателлитного профиля в опытном стаде северных оленей ненецкой породы</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Changes in the microsatellite profile in an experimental herd of Nenets reindeer</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-5485-4616</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Николаев</surname><given-names>С. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Nikolaev</surname><given-names>S. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>к. вет. н., зав. отделом оленеводства</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Candidate of Veterinary Sciences, Head of the Department of Reindeer Husbandry</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-3504-6864</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Матюков</surname><given-names>В. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Matyukov</surname><given-names>V. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>к. биол. н., вед. науч. сотр.</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Candidate of Biological Sciences, Leading Researcher</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-4557-844X</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Филатов</surname><given-names>А. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Filatov</surname><given-names>A. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>д-р. вет. н. проф., науч. сотр.</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Doctor of Veterinary Sciences, Professor, researcher</p></bio><email xlink:type="simple">fav6819@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>Ямальская опытная станция – обособленное структурное подразделение ФГБУН «Федеральный исследовательский центр Тюменский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Yamal Experimental Station is a separate structural subdivision of the Federal State Budgetary Institution "Federal Research Center Tyumen Scientific Center of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences"</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2023</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>16</day><month>10</month><year>2023</year></pub-date><volume>0</volume><issue>3</issue><fpage>275</fpage><lpage>283</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Николаев С.В., Матюков В.С., Филатов А.В., 2023</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Николаев С.В., Матюков В.С., Филатов А.В.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Nikolaev S.V., Matyukov V.S., Filatov A.V.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://vetjournal.spbguvm.ru/jour/article/view/1141">https://vetjournal.spbguvm.ru/jour/article/view/1141</self-uri><abstract><p>Цель исследований – оценка изменений аллельной структуры ДНК-микросателлитов в стаде северных оленей ненецкой породы. Работа проведена в Приуральском районе Ямало-Ненецкого автономного округа, на экспериментальном стаде животных, принадлежащих Ямальской опытной станции ТюмНЦ СО РАН. Аллелофонд включал микросателлитный профиль 300 оленей, полученный в результате исследования 2018 года и 100 животных анализа 2022 года. Установлено, что существенные преобразования наблюдались по всем локусам, за исключением NVHRT24. В микросателлитном профиле 2018 года присутствовали 6 аллелей с суммарной частотой 0,298, не выявленные в исследованиях 2022 года. В 2022 году установлено 8 аллелей с суммарной частотой 0,105 не выявленных в предыдущем исследовании. Индекс Шеннона свидетельствует о незначительном росте генетического разнообразия в анализируемой популяции (на 0,059), а так же увеличении наблюдаемой гетерозиготности животных (на 0,074). Индекс фиксации по всем анализируемым локусам показал, что как в выборке 2018 года, так и 2022, в исследуемой популяции наблюдался дефицит гетерозигот, однако, данные 2022 года указывают на снижение дефицита гетерозиготности на 0,089. Анализ дивергенции популяции по отдельным локусам свидетельствует, что максимальное расхождение аллельной структуры произошло по локусу RT9 (d=0,331), RT30 (d=0,236) и NVHRT76 (d=0,231), а максимальное сходство сохранилось по локусам NVHRT24 (d=0,007), RT1(d=0,0014) и RT7 (d=0,0020). Таким образом, можно заключить, что в исследуемой популяции наблюдался выраженный дрейф генов.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>The aim of the research is to evaluate changes in the allelic structure of DNA microsatellites in a herd of Nenets reindeer. The work was carried out in the Priuralsky district of the Yamalo-Nenets Autonomous Okrug, on an experimental herd of animals belonging to the Yamal experimental station. The allelofund included a microsatellite profile of 300 deer obtained as a result of the 2018 study and 100 animals analyzed in 2022. It was found that significant transformations were observed at all loci, with the exception of NVHRT24. In the microsatellite profile of 2018, there were 6 alleles with a total frequency of 0.298, which were not detected in the 2022 studies. In 2022, 8 alleles with a total frequency of 0.105 not identified in the previous study were established. The Shannon index indicates a slight increase in genetic diversity in the analyzed population (by 0.059), as well as an increase in the observed heterozygosity of animals (by 0.074). The fixation index for all analyzed loci showed that both in the sample of 2018 and 2022, there was a deficit of heterozygotes in the study population, however, the data of 2022 indicate a decrease in the deficit of heterozygotes by 0.089. Analysis of the divergence of the population for individual loci indicates that the maximum divergence of the allelic structure occurred at the RT9 locus (d=0.331), RT30 (d=0.236) and NVHRT76 (d=0.231), and the maximum similarity was preserved for the loci NVHRT24 (d=0.007), RT1 (d=0.0014) and RT7 (d=0.0020). Thus, pronounced gene drift was observed in the studied population.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>северные олени</kwd><kwd>микросателлиты</kwd><kwd>аллелофонд</kwd><kwd>генетические маркеры</kwd><kwd>гетерозиготность</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>reindeer</kwd><kwd>microsatellites</kwd><kwd>allelofund</kwd><kwd>genetic markers</kwd><kwd>heterozygosity</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Dotsev A.V., Kharzinova V.R., Romanenko T.M., Laishev K.A., Brem G.G., Nikitkina E.V., Zinovieva N.A. Microsatellitebased heterozygosity-fitness correlations in reindeer// Journal of Animal Science. 2019. Т. 97. № S3. С. 266.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Dotsev A.V., Kharzinova V.R., Romanenko T.M., Laishev K.A., Brem G.G., Nikitkina E.V., Zinovieva N.A. Microsatellitebased heterozygosity-fitness correlations in reindeer// Journal of Animal Science. 2019. Vol. 97. No. S3. p. 266.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kharzinova V.R., Dotsev A.V., Solovieva A.D., Fedorov V.I., Shimit L.D.O., Romanenko T.M., Senchik A.V., Sergeeva O.K., Goncharov V.V., Laishev K.A., Yuzhakov A.A., Brem G.G., Zinovieva N.A. Genetic variability of Russian domestic reindeer populations (Rangifer tarandus) by microsatellites// Journal of Animal Science. 2020. Т. 98. № 4. С. 237-238.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kharzinova V.R., Dotsev A.V., Solovieva A.D., Fedorov V.I., Shimit L.D.O., Romanenko T.M., Senchik A.V., Sergeeva O.K., Goncharov V.V., Lai-shev K.A., Yuzhakov A.A., Brem G.G., Zinovieva N.A. Genetic variability of Russian domestic reindeer populations (Rangifer tarandus) by microsatellites// Journal of Animal Science. 2020. Vol. 98. No. 4. pp. 237-238.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Radko A., Rychlik T. Use of blood group tests and microsatellite DNA markers for parentage verification in a population of Polish Red-and-White cattle Annals of Animal Science. 2009; 9 (2): 119-125.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Radko A., Rychlik T. Use of blood group tests and microsatellite DNA markers for parentage verification in a population of Polish Red-and-White cattle Annals of Animal Science. 2009; 9 (2): 119-125.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Van de Goor L. H. P., Panneman H. &amp; Van Haeringen W. A. A proposal for standardization in forensic bovine DNA typing: allele nomenclature of 16 cattle-specific short tandem repeat loci, Animal Genetics 2009, 40, 630-636.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Van de Goor L. H. P., Panneman H. &amp; Van Haeringen W. A. A proposal for standardization in forensic bovine DNA typing: allele nomenclature of 16 cattle-specific short tandem repeat loci, Animal Genetics 2009, 40, 630-636.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Артюшин И.В., Коноров Е.А., Курбаков К.А., Столповский Ю.А. Разработка системы праймеров для секвенирования митохондриального генома северного оленя Rangifer tarandus. Генетика. 2021. Т. 57. № 1. С. 103-107.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Artyushin I.V., Konorov E.A., Kurbakov K.A., Stolpovsky Yu.A. Development of a primer system for sequencing the mitochondrial genome of the reindeer Rangifer tarandus. Genetics. 2021. Vol. 57. No. 1. pp. 103-107.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лайшев К.А., Самандас А.М., Прокудин А.В., Романенко Т.М., Гончаров В.В., Мухамадеева Т.В. Ветеринарные и зоотехнические проблемы воспроизводства в северном оленеводстве и пути их решения. Достижения науки и техники АПК. 2013. № 11. С. 42-44.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Laishev K.A., Samandas A.M., Prokudin A.V., Romanenko T.M., Goncharov V.V., Mukhamadeeva T.V. Veterinary and zootechnical problems of reproduction in reindeer husbandry and ways to solve them. Achievements of science and technology of the agro-industrial complex. 2013. No. 11. pp. 42-44.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Романенко Т.М. Применение биотехнологий в северном оленеводстве. В сборнике: Проблемы животноводства Северных стран. Материалы международной научно-практической конференции. 2005. С. 64-66.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Romanenko T.M. Application of biotechnologies in reindeer herding. In the collection: Problems of animal husbandry of the Nordic countries. Materials of the international scientific and practical conference. 2005. pp. 64-66.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Романенко Т.М., Калашникова Л.А., Филиппова Г.И., Лайшев К.А. Генетическая структура популяции северных оленей о. Колгуев Ненецкого автономного округа. Достижения науки и техники АПК. 2014. № 4. С. 68-70.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Romanenko T.M., Kalashnikova L.A., Filippova G.I., Laishev K.A. Genetic structure of the reindeer population of Kolguev Island of the Nenets Autonomous Okrug. Achievements of science and technology of the agro-industrial complex. 2014. No. 4. pp. 68-70.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Романенко Т.М., Митюков А.С. Экстерьерные особенности северных оленей острова Колгуев и Малоземельской тундры в сравнительном аспекте. Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета. 2011. № 24. С. 113-118.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Romanenko T.M., Mityukov A.S. Exterior features of the northern reindeer of Kolguev Island and the Little Earth tundra in a comparative aspect. Proceedings of the St. Petersburg State Agrarian University. 2011. No. 24. pp. 113-118.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Романенко Т.М., Харзинова В.Р., Лайшев К.А. Сравнительная характеристика микропопуляций северных оленей ненецкой породы Малоземельской тундры НАО. Генетика и разведение животных. 2020. № 2. С. 37-43.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Romanenko T.M., Kharzinova V.R., Laishev K.A. Comparative characteristics of micropopulations of reindeer of the Nenets breed of the Low-Earth tundra of the NAO. Genetics and animal breeding. 2020. No. 2. pp. 37-43.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Столповский Ю.А., Бабаян О.В., Каштанов С.Н., Пискунов А.К., Сёмина М.Т., Холодова М.В., Лайшев К.А., Южаков А.А., Романенко Т.М., Лисичкина М.Г., Дмитриева Т.И., Етылина О.В., Прокудин А.В., Свищёва Г.Р. Генетическая оценка пород северного оленя (Rangifer tarandus) и их дикого предка с помощью новой панели STR-маркеров. Генетика. 2020. Т. 56. № 12. С. 1410-1426.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Stolpovsky Yu.A., Babayan O.V., Kashtanov S.N., Piskunov A.K., Semina M.T., Kholodova M.V., Laishev K.A., Yuzhakov A.A., Romanenko T.M., Lisichkina M.G., Dmitrieva T.I., Etylina O.V., Prokudin A.V., Svishcheva G.R. Genetic evaluation breeds of reindeer (Rangifer tarandus) and their wild ancestor using a new panel of STR markers. Genetics. 2020. Vol. 56. No. 12. pp. 1410-1426.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Южаков А.А., Романенко Т.М., Лайшев К.А. Новые знания, методы и модели в разведении, экологии и эпизоотологии северных оленей. Санкт-Петербург - Пушкин, 2018.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Yuzhakov A.A., Romanenko T.M., Laishev K.A. New knowledge, methods and models in breeding, ecology and epizootology of reindeer. Saint Petersburg - Pushkin, 2018.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лайшев К.А., Южаков А.А., Казановский Е.С., Чеботарев Н.Т., Жариков Я.А., Карабанов В.П., Коковкина В.С. Оценка состояния здоровья северных оленей и формирование в пределах Ямало-Ненецкого автономного округа промежуточных генеалогических групп с высокими хозяйственными качествами. Отчет о НИР по ГК № 01-19/38. 21.06.2018.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Laishev K.A., Yuzhakov A.A., Kazanovsky E.S., Chebotarev N.T., Zharikov Ya.A., Karabanov V.P., Kokovkina V.S. Assessment of the health status of reindeer and the formation of intermediate genealogical groups with high economic qualities within the Yamalo-Nenets Autonomous Okrug. Research report. No. 01-19/38. 21.06.2018.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
