В статье отражены эпизоотологические, статистические, бактериологические, вирусологические и молекулярно-генетические результаты исследований. По данным государственной ветеринарной отчетности за последние пять лет, в Вологодской области ежегодно переболевает в среднем 123,6 тыс. голов крупного рогатого скота, в том числе 34,3 тыс. голов молодняка, или 52,9±1,9% и 43,6±2,6 % соответственно от имеющегося поголовья. За анализируемый период пало 3,0 тыс. голов крупного рогатого скота, показатель смертности в среднем составил 1,8±0,1 % к обороту стада. В результате бактериологических исследований материала от больных и павших животных изолированы следующие микроорганизмы: Klebsiella (7,6 %), E. Coli (6,1 %), Proteus (5,4 %), Citrobacter (4,6 %), Salmonella enteritidis (2,3 %). При типировании культур кишечных палочек были определены следующие серологические группы: 0115; 0119; 0137, которые являются возбудителями колидиареи и септицемии, а такие как 026; 086 – мастита у коров. Патогенные свойства Escherichia, нетипируемых по антигену, а также других культур определяли в биологической пробе на белых мышах. Для диагностики вирусной диареи использовали метод ИФА. В 40,0% исследованных проб сыворотки крови результат оказался положительным. Титр антител варьировал от 1:800 до 1:6400, что говорит о циркуляции вируса и возможном этиологическом участии в заболевании животных. Сомнительный результат был получен в 25,0 % образцах. При исследовании проб носовых истечений, фекалий телят, а также влагалищной слизи у коров был обнаружен герпесвирус. При исследовании спермы быков-производителей, как возможного источника герпесвируса, методом ПЦР был выявлен альфагерпесвирус КРС в 25,0% исследованных образцов.Таким образом, основными этиологическими агентами кишечных и респираторных болезней молодняка КРС в хозяйствах области являются перечисленные выше патогенные бактерии и вирусы, что говорит о необходимости дальнейшего совершенствования системы противоэпизоотических мероприятий.