ivmМеждународный вестник ветеринарииInternational Journal of Veterinary Medicine2072-2419SpbGUVM Publishing House10.52419/issn2072-2419.2024.1.172ivm-1322Research ArticleЗООГИГИЕНА, САНИТАРИЯ, КОРМЛЕНИЕZOOHYGIENE, SANITATION, FEEDINGСравнительный анализ интестинальной микрофлоры кишечника форели радужной, отобранной с различных рыбоводных хозяйств республики КарелияComparative analysis of intestinal intestinal microflora of rainbow trout selected from various fish farms of the republic KareliaСидороваН. А.SidorovaN. A.

 канд. биол. наук, доцент 

 Cand.biol.sc. 

КарпенкоЛ. Ю.KarpenkoL. Yu.

 д-р биол. наук, проф. 

 D. Biol.sc., Professor 

l.u.karpenko@mail.ruБахтаА. А.BakhtaA. A.

 канд. биол. наук, доц. 

 Cand.biol.sc., Assoc. 

СавушкинА. И.SavushkinA. I.

 науч. сотр. 

 Research Associate 

НиконовИ. Н.NikonovI. N.

 канд. биол. наук, асс. 

 Cand.biol.sc. 

ФГБОУ ВО «ПетрГУ»РоссияPetrozavodsk State UniversityRussian FederationФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный университет ветеринарной медицины»РоссияSt. Petersburg State University of Veterinary MedicineRussian Federation20240204202401172183Copyright © Сидорова Н.А., Карпенко Л.Ю., Бахта А.А., Савушкин А.И., Никонов И.Н., 20242024Сидорова Н.А., Карпенко Л.Ю., Бахта А.А., Савушкин А.И., Никонов И.Н.Sidorova N.A., Karpenko L.Y., Bakhta A.A., Savushkin A.I., Nikonov I.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://vetjournal.spbguvm.ru/jour/article/view/1322

Микробиоценоз кишечника рыб представлен полостной и пристеночной микрофлорой, обладающей сложными функциональными связями между собой и с кишечной стенкой. Цель исследования заключалась в выявлении особенностей биоразнообразия интестинальной микрофлоры кишечника радужной форели, выращенной в рыбоводных хозяйствах Карелии. Изучение интестинальной микрофлоры кишечника радужной форели выполняли на базе рыбоводных хозяйств РК, территориально расположенных в акватории 4 водоемов, отличающихся комплексом гидрологических, гидрохимических и гидробиологических характеристик. Это Кондопожская губа Онежского озера, залив Рауталахти Ладожского озера, Крошнозеро и озеро Насоновское. Для статистической обработки полученных данных по результатам сравнительного анализа интестинальной микрофлоры кишечника исследуемых групп радужной форели применяли составление вариационного ряда, расчет средней величины исследуемого признака и среднюю стандартную ошибку. Объектом исследования для изучения состава интестинальной микрофлоры кишечника стала радужная форель Parasalmo mykiss (Walbaum, 1792) породы «Рофор». Микробиологический анализ показал, что что качественная и количественная изменчивость микробиома кишечника отличается в зависимости от среды выращивания форели. Выделены 14 функциональных групп бактерий: целлюлозолитики, бациллы, лактобациллы, бифидобактерии, селеномонады, актинобактерии, энтеробактерии, фузобактерии, пептококки, стафилококки, кампилобактерии, патогенные клостридии, пастереллы и псевдомонады. Доля целлюлозолитиков (Eubacteriaceae, Clostridiaceae, Lachnospiraceae, Ruminococcaceae, Bacteroidetes и т.д.) изменялась от 49.1 до 55.3%; бацилл – от 0,9 до 8,7%, лактобацилл – от 5,0 до 13,7%.

The microbiocenosis of the intestines of fish is represented by the abdominal and parietal microflora, which has complex functional connections with each other and with the intestinal wall. The purpose of the study was to identify the features of the biodiversity of the intestinal intestinal microflora of rainbow trout grown in fish farms in Karelia. The study of intestinal intestinal microflora of rainbow trout was carried out on the basis of fish farms of the Republic of Kazakhstan, geographically located in the water area of 4 reservoirs, characterized by a complex of hydrological, hydrochemical and hydrobiological characteristics. These are the Kondopoga Bay of Lake Onega, the Rautalakhti Bay of Lake Ladoga, Kroshnozero and Lake Nasonovskoye. For statistical processing of the data obtained based on the results of a comparative analysis of the intestinal intestinal microflora of the studied groups of rainbow trout, the compilation of a variation series, the calculation of the average value of the studied trait and the average standard error were used. The object of the study to study the composition of intestinal intestinal microflora was the rainbow trout Parasalmo mykiss (Walbaum, 1792) of the Rofor breed. Microbiological analysis has shown that the qualitative and quantitative variability of the gut microbiome differs depending on the trout growing environment. 14 functional groups of bacteria were identified: cellulolytics, bacilli, lactobacilli, bifidobacteria, selenomonas, actinobacteria, enterobacteria, fusobacteria, peptococci, staphylococci, campylobacteria, pathogenic clostridia, pasteurella and pseudomonas. The proportion of cellulolytics (Eubacteriaceae, Clostridiaceae, Lachnospiraceae, Ruminococcaceae, Bacteroidetes, etc.) varied from 49.1 to 55.3%; bacilli – from 0.9 to 8.7%, lactobacilli – from 5.0 to 13.7%.

аквакультурамикробиоммониторинградужная форельaquaculturemicrobiomemonitoringrainbow troutИсследование выполнено при поддержке гранта Российского научного фонда № 322-23 (Соглашение № 23-16-20026), проводимого совместно с Республикой Карелия с финансированием из Фонда венчурных инвестиций Республики Карелия (ФВИ РК).ReferencesАртамонова В.С., Махров А. А. Популяционная структура семги (Salmo salar L.) и ее изменение под влиянием рыбоводства // Ихтиофауна малых рек и озер Восточного Мурмана: биология, экология, ресурсы. Апатиты: КНЦ РАН, 2005. С. 144–157.Artamonova V.S., Makhrov A. A. The population structure of salmon (Salmo salar L.) and its change under the influence of fish farming // Ichthyofauna of small rivers and lakes of Eastern Murmansk: biology, ecology, resources. Apatity: KSC RAS, 2005. pp. 144-157.Ивантер Э. В. Основы вариационной статистики. Петрозаводск: Петрозаводский государственный университет имени О. В. Куусинена, 1970. 18 с.Ivanter E. V. Fundamentals of variational statistics. Petrozavodsk: Petrozavodsk State University named after O. V. Kuusinen, 1970. 18 p.Маннапова Р. Т. Микробиология. Практикум для выполнения лабораторнопрактических работ. М.: Проспект, 2021. 440 с.Mannapova R. T. Microbiology. A workshop for performing laboratory and practical work. M.: Prospect, 2021. 440 p.Определитель бактерий Берджи / Под ред. Дж. Хоулта. М.: Мир, 1997. 444 с.The determinant of Bergey bacteria / Edited by J. Hoult. M.: Mir, 1997. 444 p.Руководство по ветеринарно-санитарному контролю племенных рыбоводных хозяйств: науч.-практ. изд. 2018. М.: Изд-во ФГБНУ «Росинформагротех», 52 с.Guidelines for veterinary and sanitary control of breeding fish farms: scientific and practical ed. 2018. Moscow: Publishing House of the Federal State Budgetary Budgetary Institution "Rosinformagrotech", 52 p.Huber I., Spanggaard B., Appel K. F., Rossen L., Nielsen T., Gram L. J. Phylogenetic analysis and in situ identification of the intestinal microbial community of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) // Appl. Microbiol. 2004. № 96(1):117-32. doi: 10.1046/j.1365-2672.2003.02109. x.Huber I., Spanggaard B., Appel K. F., Rossen L., Nielsen T., Gram L. J. Phylogenetic analysis and in situ identification of the intestinal microbial community of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) // Appl. Microbiol. 2004. № 96(1):117-32. doi: 10.1046/j.1365-2672.2003.02109. x.Parshukov A.N., Kashinskaya E.N., Simonov E.P., Hlunov O.V., Izvekova G.I., Andree K.B., Solovyev M.M. Variations of the intestinal gut microbiota of farmed rainbow trout, Oncorhyn-chus mykiss (Walbaum), depending on the infection status of the fish // Journal of Applied Microbiology. 2019, V.127, Issue 2. Р. 379–395.Parshukov A.N., Kashinskaya E.N., Simonov E.P., Hlunov O.V., Izvekova G.I., Andree K.B., Solovyev M.M. Variations of the intestinal gut microbiota of farmed rain bow trout, Oncorhyn-chus mykiss (Walbaum), depending on the infection status of the fish // Journal of Applied Microbiology. 2019, V.127, Issue 2. pp. 379-395.Pelusio N. F. et al. Effects of increasing dietary level of organic acids and natureidentical compounds on growth, intestinal cytokine gene expression and gut microbiota of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) reared at normal and high temperature //Fish & shellfish immunology. 2020. V. 107. Pt A. Р. 324-335.Pelusio N. F. et al. Effects of increasing dietary level of organic acids and natureidentical compounds on growth, intestinal cytokine gene expression and gut microbiota of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) reared at normal and high temperature //Fish & shellfish immunology. 2020. V. 107. Pt A. R. 324-335.Pond M. J., Stone D. M., Alderman D. J. Comparison of conventional and molecular techniques to investigate the intestinal microflora of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) // Aquaculture. 2006. № 261 (1). Р. 194-203.Pond M. J., Stone D. M., Alderman D. J. Comparison of conventional and molecular techniques to investigate the intestinal microflora of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) // Aquaculture. 2006. No. 261 (1). pp. 194-203.Sehnal L., Brammer-Robbins E., Wonnington A. M., Blaha L., Bisesi J., Larkin I., Martyniuk C. J., Simonin M., Adamovsky O. Microbiome composition and function in aquatic vertebrates: small organisms making big impacts on aquatic animal health // Frontiers in microbiology. 2021. № 12. Article number 567408. DOI: 10.3389/fmicb.2021.567408.Sehnal L., Brammer-Robbins E., Wonnington A. M., Blaha L., Bisesi J., Larkin I., Martyniuk C. J., Simonin M., Adamovsky O. Microbiome composition and function in aquatic vertebrates: small organisms making big impacts on aquatic animal health // Frontiers in microbiology. 2021. № 12. Article number 567408. DOI: 10.3389/fmicb.2021.567408.Spanggaard B., Huber I., Nielsen J., Nielsen T. The microflora of rainbow trout intestine: A comparison of traditional and molecular identification // Aquaculture. 2000. № 182(1-2). Р. 1-15.Spanggaard B., Huber I., Nielsen J., Nielsen T. The microflora of rainbow trout intestine: A comparison of traditional and molecular identification // Aquaculture. 2000. No. 182(1-2). pp. 1-15.Vasemagi A., Visse М., Кisand V. Effect of environmental factors and an emerging parasitic disease on gut microbiome of wild salmonid fish // M Sphere. 2017. № 2 (6). Article number e00418-17. DOI: 10.1128/mSphere.00418-17.Vasemagi A., Visse M., Kisand V. Effect of environmental factors and an emerging parasitic disease on gut microbiome of wild salmonid fish // M Sphere. 2017. № 2 (6). Article number e00418-17. DOI: 10.1128/mSphere.00418-17.Zhou C., Yang S., Ka W., et al. Association of Gut Microbiota with Metabolism in Rainbow Trout Under Acute Heat Stress // Frontiers in Microbiology. 2022. № 13. Р. 846-856.Zhou C., Yang S., Ka W., et al. Association of Gut Microbiota with Metabolism in Rainbow Trout Under Acute Heat Stress // Frontiers in Microbiology. 2022. No. 13. pp. 846-856.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.