Генетическая изменчивость генофондных пород кур, оцененная на основе анализа SNPS в гене PPARG

Ожирение кур значительно снижает эффективность кормления, яйценоскость, вкусовые качества мясной тушки, убойный выход, потребительскую ценность, а также присутствует такой экологический аспект, как проблема утилизации жира. Поиск SNPs в генах, участвующих в липидном обмене, важная задача на сегодняшний день для современных исследований в области птицеводства. Различия по жирности тушки между породами и линиями внутри породы иллюстрируют важность генетических факторов в липидном обмене у кур. Целью исследования являлся поиск и анализ SNPs в гене PPARG методом секвенирования у различных пород кур (n=83). Исследования проводили на базе лаборатории молекулярной генетики ВНИИГРЖ. Объектом исследования были куры биоресурсной коллекции ВНИИГРЖ «Генетическая коллекция редких и исчезающих пород кур» (г. Пушкин, Санкт-Петербург) различного направления продуктивности (n=83). Кровь для выделения ДНК отбирали у кур в возрасте 330 дней из вены крыла в микропробирку, содержащую в качестве антикоагулянта 50 мкл 0,5 мМ ЭДТА. До использования образцы крови хранили при температуре -200С. Геномную ДНК выделяли стандартным фенольно-детергентным способом. Концентрацию и степень чистоты образцов определяли с помощью прибора NanoDrop 2000 (Thermo Fisher, США).

Анализ полиморфизма регуляторной области гена PPARG проводился методом секвенирования. Дизайн праймеров проводили на основании информации базы данных сети интернет. Способ содержания птицы – индивидуальный клеточный. Определена генетическая изменчивость по rs314476701 гена PPARG у анализируемых пород. По SNP rs316237745 для всех особей изучаемых групп кур было выявлено сильное смещение аллеля A.

1. Wang, H.B. Profiling of chicken adipose tissue gene expression by genome array / H.B. Wang, H. Li, Q.G. Wang, X.Y. Zhang, S.Z. Wang, Y.X. Wang, X.P. Wang // BMC Genom. − 2007. – N 8. – P. 193. doi: 10.1016 /j.domaniend.2004.05.003.

2. Navidshad, B. Ligands and Regulatory Modes of Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma (PPARγ) in Avians / B. Navidshad and Royan M. // Crit Rev Eukaryot Gene Expr. − 2015. – N. 25(4). − P. 287- 292. doi: 10.1615/critreveukaryotgeneexpr.

3. Sato, K. Changes in peroxisome proliferator-activated receptor gamma gene expression of chicken abdominal adipose tissue with different age, sex and genotype / K. Sato, H. Abe, T. Kono, M. Yamazaki, K. Nakashima, T. Kamada, Y. Akiba // Anim. Sci. J. − 2009. – N. 80. – P. 322–327.

4. Wang, Y. Peroxisome proliferatoractivated receptor-gamma gene: a key regulator of adipocyte differentiation in chickens / Y. Wang, Y. Mu, N. Ding, Q. Wang, S. Wang, N. Wang // Poultry Science. − 2008. – N. 87. − P. 226-232. doi: 10.3382/ps.2007-00329.

5. Mihelic, R. Genes controlling polyunsaturated fatty acid synthesis are developmentally regulated in broiler chicks / R. Mihelic, H. Winter, J.B. Powers, S. Das, K. Lamour, S.R. Campagna, B.H. Voy // Br Poult Sci. − 2020. − N 61(5). − P. 508-517. doi: 10.1080/00071668.2020.1759788.

6. Tunim, S. Increasing Fat Deposition Via Upregulates the Transcription of Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma in Native Crossbred Chickens / S. Tunim, Y. Phasuk, S.E. Aggrey, M. Duangjinda // Animals (Basel). − 2021. − N 11(1). doi: 10.3390/ani11010090.

7. Sun, G. Krüppel-like factor KLF9 inhibits chicken intramuscular preadipocyte differentiation / G. Sun, M. Zhang, J. Sun, F. Li, X. Ma, W. Li, R. Han, Z. Li, R. Jiang, G. Li, F. Yan, X. Kang // Br Poult Sci. – 2019. – N 60(6) − P. 790-797. doi: 10.1080/00071668.2019.1657229.