Сравнительный анализ фенотипических и генетических корреляций между зоотехническими признаками у домашних северных оленей

Исследования проводились с целью определения возможности использования фенотипических корреляций между признаками в качестве косвенного показателя генетических корреляций у домашних северных оленей (Rangifer tarandus L.). Оценка фенотипических показателей экстерьера и живой массы северных оленей была проведена на Ямальской опытной станции - обособленном структурном подразделении ФГБУН ФИЦ Тюменский научный центр СО РАН. Объектом исследования была популяционная выборка из 94 взрослых самок ненецкой породы, отобранных случайным образом, без пороков телосложения и имевших теленка. в октябре 2020 года. Всего было обследовано 94 важенки (взрослых самок) в возрасте от 3 до 9 лет. Животные были упитанными, имели теленка и не имели видимых пороков телосложения. В выборке наблюдались высокие положительные фенотипические корреляции между «высотой в холке» и «высотой в локте» (0.84), «высотой в холке» и «глубиной груди» (0.71), «живой массой» и «обхватом груди» (0.63), а также между «живой массой» и «глубиной груди» (0.6). Генетические корреляции между признаками, вычисленные по генотипам микросателлитных маркеров, показали сопоставимые результаты. Для пары промеров «высота в холке» и «высота в локте» генетическая корреляция составила около 0.83, а для пары «высота в холке» и «глубина груди» - около 0.71. Результаты сравнительного анализа между фенотипическими и генетическими корреляционными матрицами продемонстрировали высокую степень согласованности. Было показано, что для селекции северных оленей по живой массе и линейным размерам тела фенотипические корреляции потенциально могут использоваться в качестве косвенного показателя генетических корреляций.

1. Скуридин Г. М., Коваль С.Ф. Идентификация генотипа по фенотипу с помощью корреляций признаков. // Информационный вестник ВОГиС, 2002. 6(19): p. 3-3.

2. Sodini S.M. et al. Comparison of genotypic and phenotypic correlations: Cheverud’s conjecture in humans. //Genetics, 2018. 209 (3): p. 941-948.

3. Cheverud J. M. A comparison of genetic and phenotypic correlations //Evolution, 1988. 42(5): p. 958-968.

4. Waitt D.E., Levin D.A. Genetic and phenotypic correlations in plants: a botanical test of Cheverud's conjecture //Heredity, 1998. 80(3): p. 310-319.

5. Ackermann R.R., Cheverud J.M. Discerning evolutionary processes in patterns of tamarin (genus Saguinus) craniofacial variation //American Journal of Physical Anthropology: The Official Publication of the American Association of Physical Anthropologists, 2002. 117(3): p. 260-271.

6. Reusch T. Blanckenhorn W. Quantitative genetics of the dung fly Sepsis cynipsea: Cheverud's conjecture revisited. //Heredity, 1998. 81(1): p. 111-119.

7. Деряженцев В.Т., Шифнер К.Г. Наследственность и коррелятивные связи некоторых хозяйственно-полезных признаков северных оленей. //Науч. тр, Магадан. зон. НИИСХ Северо-Востока. 1978(7): p. 4-11.

8. Рожков Ю.И., Проняев А.В. Коэффициенты сходства между популяциями по количественным признакам и генотипам. //Сельскохозяйственная биология. 1992(6): p. 26-35.

9. Южаков А.А, Романенко Т.М., Лайшев К.А. Феногеографическая изменчивость северных оленей ненецкой породы // Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета. 2017(2 (47)): p. 115-122.

10. Южаков, А.А О наследуемости и повторяемости живой массы у северных оленей //Сибирский вестник сельскохозяйственной науки 2003(3): p. 165-167.

11. Южаков А.А., Лайшев К.А., Забродин В.А. Влияние наследственных и паратипических факторов на мясную продуктивность домашних северных оленей // Аграрный вестник Урала. 2020(11 (202)): p. 93-100.

12. Røed K.H. et al. Genetic analyses reveal independent domestication origins of Eurasian reindeer //Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 2008. 275 (1645): p. 1849-1855.

13. McLoughlin P.D. et al. Genetic diversity and relatedness of boreal caribou populations in western Canada //Biological Conservation. 2004. 118(5): p. 593-598.

14. Colson K.E., Mager K.H., Hundertmark K.J. Reindeer introgression and the population genetics of caribou in southwestern Alaska //Journal of Heredity. 2014. 105(5): p. 585-596.

15. Zhai J.-C. et al. Analysis on genetic diversity of reindeer (Rangifer tarandus) in the Greater Khingan Mountains using microsatellite markers //Zoological studies. 2017. 56.

16. Kashtanov S.N., Zakharov E.S., Semina M.T. et al. Genetic Structure of Domesticated Reindeer (Rangifer tarandus) Populations in the Central Siberian Plateau and Adjacent Areas //Russian Journal of Genetics. 2024. 60(1): p. 121-125.

17. Семина М.Т., Свищева Г.Р., Сипко Т.П. и др. Популяционная структура домашних и диких популяций северного оленя (Rangifer tarandus) //Материалы научной конференции с международным участием, посвященной 50-летнему юбилею лаборатории популяционной генетики им. Ю. П. Алтухова ИОГен РАН. 2022. С. 53.

18. Дьяченко Н.А. Рекомендации по племенной работе в северном оленеводстве. 1970.

19. Столповский Ю.А., Бабаян О.В., Каштанов С.Н. и др. Генетическая оценка пород северного оленя (Rangifer tarandus) и их дикого предка с помощью новой панели STR–маркеров //Генетика. 2020. Т. 56. № 12. С. 1410–1426.

20. Jombart, T. Adegenet: a R package for the multivariate analysis of genetic markers //Bioinformatics. 2008. 24(11): p. 1403-1405.

21. Paradis, E. Pegas: an R package for population genetics with an integrated–modular approach //Bioinformatics 2010. 26(3): p. 419-420.

22. Kamvar Z.N., Tabima J.F., Grünwald N.J. Poppr: an R package for genetic analysis of populations with clonal, partially clonal, and/or sexual reproduction //PeerJ, 2014. 2: p. e281.

23. Adamack A.T., Gruber B. PopGenReport: simplifying basic population genetic analyses in R //Methods in Ecology and Evolution. 2014. 5(4): p. 384-387.

24. Suzuki R., Shimodaira H. Pvclust: an R package for assessing the uncertainty in hierarchical clustering //Bioinformatics. 2006. 22(12): p. 1540-1542.

25. Goudet J. Hierfstat, a package for R to compute and test hierarchical F‐statistics. // Molecular Ecology Notes. 2005. 5(1): p. 184-186.

26. Agapow P.M., Burt A. Indices of multilocus linkage disequilibrium //Molecular Ecology Notes. 2001. 1(1‐2): p. 101-102.

27. Brown A., Feldman M., Nevo E. Multilocus structure of natural populations of Hordeum spontaneum //Genetics. 1980. 96 (2): p. 523-536.

28. Kraft P., Chen H., Lindström S. The Use of Genetic Correlation and Mendelian Randomization Studies to Increase Our Understanding of Relationships between Complex Traits //Current Epidemiology Reports. 2020. 7: p. 104-112.