Особенности микробиома рубца у северных оленей при некробактериозе

Северные олени являются уникальным видом животных, которые приспособились к суровым арктическим условиям. Адаптационные особенности строения желудочно-кишечного тракта северных оленей позволяет поедать активно переваривать и усваивать лишайники, листву, кустарники, подснежную зелень. Наряду с полезной микрофлорой, в рубце северных оленей обитают патогенные и условно патогенные микроорганизмы. Цель наших исследований - изучить и сравнить особенности микробиома рубца у здоровых и больных некробактериозом северных оленей. Предметом исследования служили пробы рубцового содержимого, отобранные у 38 северных оленей (Rangifer tarandus) ненецкой породы разных возрастных групп. Изучения микробиома проводили способом NGSсеквенирования на платформе для секвенирования последующего поколения MiSeq (Illumina, США) с применением праймеров для V3-V4 региона 16S рРНК.
На основании проведенных исследований удалось установить, что микробиом рубца северных оленей в летний и зимний периоды характеризуется определенными отличиями. В летний пастбищный период регистрируется наличие большего количества таких патогенных бактерий, как Fusobacterium sp., Parvimonas sp. и Porphyromonas endodontalis, при этом в спектре патогенных микроорганизмов наиболее часто выделяли бактерий рода Fusobacterium, которые считаются основным инфекционным возбудителем при некробактериозе. В этот же период в пробах рубца у оленей устанавливали наличие бактерий рода Sharpea, входящих в филу Erysipelotrichaceae, которые ферментируют сахара с образованием молочной кислоты и могут вызывать развитие лактатного ацидоза. У телят в процессе болезни снижается количество грибов-хитридиомицетов, которые, участвуют в ферментации полисахаридов.

1. Забродин В.А., Лайшев К.А., Белова Л.М., Логинова О.А., Савельев Д.В., Лайшев А.Х., Климонтов М.И., Мицкевич В.Ю., Силков А.М. Болезни северных оленей Санкт-Петербург - Пушкин.- 2019. - 270 с.

2. Ilina L.A., Filippova V.A., Brazhnik E.A., Dubrovin A.V., Yildirim E.A., Dunyashev T.P., Laptev G.Y., Novikova N.I., Sobolev D.V., Yuzhakov A.A., Laishev K.A. The comparative analysis of the ruminal bacterial population in reindeer (Rangifer tarandus l.) from the Russian Arctic zone: regional and seasonal effects //Animals.- 2021.- Т. 11. № 3. С. 1-18.

3. Ильина Л.А.; Лайшев К.А, Лаптев Г.Ю.; Никонов И.Н., Зайцев С.Ю. Молекулярно-генетический подход к оценке микробного сообщества рубца северного оленя //Ветеринария, зоотехния и биотехнология.- 2017.- № 9. - С. 45-50.

4. Прокудин А.В., Лайшев К.А. Актуальная эпизоотология инфекционных болезней домашних северных оленей полуострова Таймыр: некробактериоз // Иппология и ветеринарияю.- 2019.- № 4.- С. 26-30.

5. Маслова Е.Н., Куртеков В.А. Анализ заболеваемости некробактериозом северных оленей в условиях ЯНАО Тазовского района //Научная жизнь.- 2018.- №11.- С. 104-110.

6. Плохова А.А. Эпизоотическая ситуация и разработка научно обоснованной системы ветеринарно-санитарных мероприятий по борьбе с некробактериозом северных оленей в Российской Федерации: Автореф. дис. канд. ветеринар. наук, Щелково.- 2007. - 26 с.

7. Самандас А.М. Оптимизация системы защиты северных оленей от гнуса, оводов и некробактериоза на Крайнем Севере: Автореф. дис. д-ра ветер. наук, СПб.- 2011. - 47 с.

8. Маслухин Б.В и Маслухина А. Г О носительстве северными оленями возбудителя некробациллеза и культурнобиохимических свойствах бактерий некроза, выделенных из рубца // Тр. НИИСХ Крайнего Севера,- 1971.- Т. 19.- С. 34-49.

9. Самойлов С.Г. Эпизоотологическое обоснование и оптимизация лечебно-профилактических мероприятий при некробактериозе северных оленей: Автореф. дис. канд. ветеринар. наук.- Новосибирск, 2006. - 18 с.

10. Nocek, J. E. Bovine acidosis: implications on laminitis. J. Dairy Sci., 1997, 80: 1005-1028

11. Oliveros, J.C. Venny. An interactive tool for comparing lists with Venn’s diagrams. 2015 https:// bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

12. Smith, G. R., Till, D., Wallace, L. M., Noakes, D. E. Enhancement of the infectivity of Fusobacterium necrophorum by other bacteria. Epidemiol. Infect.- 1989.- 102(3): 447-458.

13. Sundse,t M. A., Præsteng, K. E., Cann, I. K. O., Mathiesen, S. D., Mackie, R. I., Novel rumen bacterial diversity in two geographically separated sub-species of reindeer // Microbial. Ecol., 2007, 54(3), 424–438.