Анализ полиморфизма гена лиганд-зависимого ядерого рецептора типа корепрессора северного оленя

В России северный олень является сельскохозяйственным животным. Были выведены и активно используются в арктической зоне России четыре породы северного оленя (эвенская, эвенкийская, ненецкая, чукотская). Наиболее распространенными и многочисленными породами оленей, разводимых в Арктической зоне России, являются ненецкая и эвенкийская. Они существенно отличаются размерами и массой тела, а также зоной обитания, так ненецкая порода обитает в тундровой зоне, эвенкийская - в таежной. Кроме того, в Арктической зоне имеются большие популяции дикого северного оленя. Исследования в области генетики мясной продуктивности сельскохозяйственных животных выявили несколько генов, определяющих формирование и развитие мышечной массы. Полиморфизм в гене LCORL ассоциирован с показателями размера тела у различных видов млекопитающих. Целью данного исследования было обнаружение вариантов генетического полиморфизма кодирующего участка гена LCORL у домашних северных оленей. LCORL (мРНК-лиганд-зависимый ядерный рецептор типа корепрессора) представляет собой фактор транскрипции, расположенный в ядре и использует консервативный мотив спираль-поворот-спираль для связывания ДНК. Проведенные исследования двух участков экзона 7 гена LCORL у особей диких и домашних северных оленей выявили наличие семи однонкулеотидных полиморфизмов, шесть из которых являются несинонимичными, т.е. приводящими к замене аминокислот в белковой последовательности. Различия частот встречаемости аллелей дикого типа и мутантных аллелей между особями диких и двух пород домашних северных оленей свидетельствует о наличие селекционного давления на регион гена LCORL и косвенно подтверждает влияние генетической изменчивости данного локуса на фенотипическую изменчивость показателей роста и размера тела у северных оленей. Учитывая аналогии с исследованиями влияния гена LCORL на признаки размера у других видов животных можно предположить, что некоторые полиморфизмы в исследованном участке могут быть истинными причинными локусами количественных признаков у домашних северных оленей.

1. Pryce J.E., Hayes B.J., Bolormaa S., Goddard M.E. Polymorphic regions affecting human height also control stature incattle. 2011. Genetics. 187. 981-984.

2. Boyko A.R., Brooks S.A., Behan-Braman A., Castelhano M., Corey E., Oliveira K.C. Genomic analysis establishes correlation between growth and laryngeal neuropathy in thoroughbreds. 2014. BMC Genomics. 15, 259.

3. Randhawa I.A., Khatkar M.S., Thomson P.C., Raadsma H.W. Composite selection signals for complex traits exemplified through bovine stature using multi-breed cohorts of European and African Bos taurus. 2015. G3 (Bethesda). 5. 1391-1401.

4. Liu R.R., Sun Y.F., Zhao G.P., Wang H.Y., Zheng M.Q., Liu L. Identification of loci and genes for growth related traits from a genome-wide association study in a slow-fast-growing broiler chicken cross. 2015. Genes & Genomics. V.37. 829836.

5. Kijas J. W. Haplotype-based analysis of selective sweeps in sheep. 2014. Genome. 57. 433-437.

6. Vaysse A., Ratnakumar A., Derrien T., Axelsson E., Rosengren Pielberg G., Sigurdsson S. Identification of genomicregions associated with phenotypic variation between dog breedsusing selection mapping. 2011. PLoS Genetics. 7. e1002316

7. Rubin C.J., Megens H.J., Martinez Barrio A., Maqbool K., Sayyab S., Schwochow D. Strong signatures of selection in the domestic pig genome. 2012. Proc. Natl. Acad. Sci. USA.109. 1952919536.

8. Weikard R., Altmaier E., Suhre K., Weinberger K.M., Hammon H. M., Albrecht E. Metabolomic profiles indicatedistinct physiological pathways affected by two loci with major divergent effect on Bos Taurus growth and lipid deposition. 2010. Physiol. Genomics. 42A. 79-88.

9. Lindholm-Perry A.K., Sexten A.K., Kuehn L.A., Smith T.P., King D.A., Shackelford S.D. Association, effects and validation of polymorphisms within the NCAPG-LCORL locus located on BTA6 with feed intake, gain, meat and carcass traits in beef cattle. 2011. BMC Genet. 12. 103.

10. Taylor R.S., Horn R.L., Zhang X., Golding G.B., Manseau M., Wilson P.J. The Caribou (Rangifer tarandus) Genome. 2019. Genes. 10(7). 540.

11. Weldenegodguad M., Pokharel K., Ming Y., Honkatukia M., Peippo J., Reilas T, Raed K.H., Kantanen J. Sequencing of reindeer (Rangifer tarandus) genomes: Insights into evolution, domestication, and adaptation. 2019. Proc. of the 37th International Conference on Animal Genetics. Spain (Lleida). 42.

12. Saif R., Henkel J., Jagannathan V., Drogemuller C., Flury C., Leeb T. The LCORL Locus Is under Selection in Large-Sized Pakistani Goat Breeds. 2020. Genes. 11. 168.