Взаимосвязь полиморфизма генов FSHR и INHBA с качеством эякулята у собак различных пород

Качество спермы играет решающую роль в успешной реализации программ разведения, особенно там, где практикуется искусственное осеменение. Кобели с отличным качеством спермы имеют хорошую фертильность и могут давать более крупные пометы, так же их эякулят лучше переносит консервацию. Целью этого исследования является экспериментальное и аналитическое подтверждение гипотезы связи SNP экзонов генов-кандидатов FSHR и INHBA с качеством спермы кобелей. В ходе математического анализа полученных нами эксперементальных данных геномных ассоциаций (GWAS) удалось идентефицировать геномные области и индивидуальные вариации, связанные с производственными признаками у собак. При подборе праймеров для амплификации исследуемого 2 экзона гена FSHR и 9, 10 экзонов гена INHBA использовалась референсная последовательность генома домашней собаки (Canis familiaris) из международной базы генетических данных NCBI. Подбор праймеров осуществлялся с помощью приложения Primer-BLAST интегрированного в NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/). Праймеры сконструированы ООО «Синтол» по индивидуальному запросу. Амплификация проводилась на термоциклере С-1000 (BioRad). Секвенирование амплифицированных фрагментов осуществляли с использованием технологии нанопорового секвенирования на приборе MinION. Для приготовления библиотек ДНК применяли набор «Rapid Sequencing Kit. Определение вариантов производилось с применением программы longshot (v. 1.0.0). Результаты анализа демонстрируют статистически значимое влияние (p<0,01) генов INHBA2 и FSHR, содержащих SNP-мутации в изученных локусах, на качество эякулята у собак. Эти находки вносят вклад в малоизученную область генетики домашних животных-компаньонов. Полученные данные открывают новые возможности для диагностики причин бесплодия кобелей. Выявленные закономерности задают четкое направление для дальнейшей работы: валидации на расширенной выборке и поиска новых значимых генетических маркеров.

1. Suchocki T., Szyda J. Genome-wide association study for semen production traits in Holstein-Friesian bulls // Journal of Dairy Science. 2015. Vol. 98, No 8. P. 5774–5780. DOI: 10.3168/jds.2014-8951.

2. Modiba M.C., Nephawe K.A., Mdladla K.H., Lu W., Mtileni B. Candidate genes in bull semen production traits: An information approach review // Veterinary Sciences. 2022. Vol. 9, No 4. P. 155. DOI: 10.3390/vetsci9040155.

3. Diniz D.B., Lopes M.S., Broekhuijse M.L.W.J., Lopes P.S., Harlizius B., Guimarães S.E.F., Duijvesteijn N., Knol E.F., Silva F.F. A genome-wide association study reveals a novel candidate gene for sperm motility in pigs. Anim. Reprod. Sci. 2014;151:201–207. DOI: 10.1016/j.anireprosci.2014.10.014.

4. Gottschalk M, Metzger J, Martinsson G, Sieme H, Distl O. Genome-wide association study for semen quality traits in German Warmblood stallions. Anim Reprod Sci. 2016 Aug;171:81-6. DOI: 10.1016/j.anireprosci.2016.06.002. Epub 2016 Jun 8. PMID: 27334685.

5. Serrano M, Ramón M, Calvo JH, Jiménez MÁ, Freire F, Vázquez JM, Arranz JJ. Genome-wide association studies for sperm traits in Assaf sheep breed. Animal. 2021 Feb;15(2):100065. doi: 10.1016/j.animal.2020.100065. Epub 2020 Dec 27. PMID: 33573944.

6. Wang K, Kang Z, Jiang E, Yan H, Zhu H, Liu J, Qu L, Lan X, Pan C. Genetic effects of DSCAML1 identified in genomewide association study revealing strong associations with litter size and semen quality in goat (Capra hircus). Theriogenology. 2020 Apr 1;146:20-25. DOI: 10.1016/j.theriogenology.2020.01.079. Epub 2020 Feb 1. PMID: 32036056.

7. Выделение ДНК теоретические основы [Электронный ресурс]. — Режим доступа: https://vniigen.ru/wp-content/uploads/2023/07/%D0%A0%D1%8F%D0%B1%D0%BE%D0%B2%D0%B0-%D0%90.%D0%95 , свободный — (22.04.2025г)

8. Богданова С.С., Крутикова А.А., Никиткина Е.В., Рябова А.Е., Мусидрай А.А., Племяшов К.В., Волков К.С., Анипченко П.С. Полиморфизм генов FSHR и INHBA у собак различных пород. Международный вестник ветеринарии. 2025 (2) DOI: 10.52419/issn2072-24.19/2025/2

9. Chew T, Haase B, Bathgate R, Willet CE, Kaukonen MK, Mascord LJ, Lohi HT, Wade CM. A Coding Variant in the Gene Bardet-Biedl Syndrome 4 (BBS4) Is Associated with a Novel Form of Canine Progressive Retinal Atrophy. G3 (Bethesda). 2017 Jul 5;7(7):2327-2335. DOI: 10.1534/g3.117.043109. PMID: 28533336; PMCID: PMC5499139.